José Joaquín Rodríguez es doctor en Historia y ejerce como docente de Educación Secundaria y en el máster oficial de Estudios Hispánicos de la Universidad de Cádiz. Entre 2014 y 2019 también fue profesor en el programa Northwest-Cádiz Program de la University of Washington.
Sus trabajos de investigación giran en torno a la cultura de masas, principalmente el cómic y los videojuegos, dando lugar a publicaciones como Los cómics de la Segunda Guerra Mundial (2010), King Kirby: Jack Kirby y el mundo del cómic (2013), Inventando Hyrule: La historia de The Legend of Zelda (2018) o Fabricantes de viñetas: Marvel Comics y la industria de la historieta estadounidense del siglo XX (2019).
Fue codirector de Revista de Historia Ubi Sunt? e Historietas. Revista de estudios sobre la historieta, y ha sido revisor para otras publicaciones académicas como Cuadernos de Historia Contemporánea y Revista Historia Autónoma. Actualmente pertenece a los comités científicos de la revista española Tebeosfera y la brasilera Diálogo, es miembro del grupo de investigación Género e Historia (HUM306) y participa en el proyecto de investigación I+D “Espacios de conocimiento, cultura y agencia femeninas en el mundo Moderno y Contemporáneo (siglos XV-XX)”.