En los años ochenta creó varios fanzines y estructuras de cómic alternativo como Le lynx à tifs, AANAL, Labo, caldo d ecultivo que llevó en 1990 a la fundación de L'Association: Mattt Konture, Killoffer, Lewis Trondheim, David B., Stanislas, MoKeït y el propio Menu.
JC Menu dirigió la Asociación durante 21 años, consolidandola como la editorial alternativa más importante del panorama editorial francés. Dejó L'Association en 2011 para dedicarse a su nueva editorial L'Apocalypse.
Su trabajo como autor de cómics le permite explorar distintos géneros, formatos y contribuir a su evolución: la autobiografía (Livret de phamille), los seriales (Le Mont-Vérité, La topographie interne du M.), la teoría (La bande dessinée et son double, Plates-Bandes), los límites del medio (Oubapo), diario sobre rock (Lock groove comix), el humor (Meder), tiras y otras investigaciones (Gnognottes).